va a discrezione dell'utente, se preferisce fare piazza pulita e rimettersi le mod, o patchare solo, con poki click
poi metti che per le troppe mod nn riesce a usare la patch? cosa fa? fa le centinaia di modifiche a mano? nn mi sembra il caso

il package puoi eliminarlo, basta che nnlo disinstalli
P.S. dai un occhio anche qua
http://www.smitalia.net/community/index.php?topic=3969.msg21443#new